غالب افرادی که هلیکوباکتر پیلوری در دستگاه گوارش آن ها کلونیزه شده است، دچار تغییرات بالینی نمی شوند.
حدود ۱۰-۱۵ درصد افراد با هلیکوباکتری پیلوری به سمت بروز بیماری های مرتبط می روند. این بیماری ها شامل زخم پپتیک، آدنوکارسینوم معده و لنفوم معده و دیس پپسی عملکردی است.